牛油果的病害种类繁多，常见的有炭疽病、疮痂病、尾孢斑点病和小穴壳果腐病。尤其是炭疽病对果实的危害较大，使果实出现凹陷的圆斑，为了防治炭疽病，可以采取低温贮藏的方式。而疮痂病虽然会出现病斑，但不会影响果肉的品质，可使用波尔多液进行治疗。尾孢斑点病会导致果实开裂，进而使得其他病菌侵入，可通过使用嘧菌酯进行防治。
一、炭疽病
炭疽病是牛油果的一种重要病害，对果实的危害能力较强，同时也会感染叶子、花和嫩枝等部位。患病的果实会先长出直径不超过5毫米的病斑，形状为圆形。随后病斑会逐渐扩大，并向内凹陷。果实成熟后，病菌还会侵入果肉，导致果肉腐烂。发病期间需要将患病的枝叶及时剪除，以免相互传染。采摘后的果实需要进行低温贮藏，并在运输过程中避免损伤。
二、疮痂病
疮痂病与炭疽病的情况相似，患病后会出现圆形褐色的突起，随后逐渐变为浅紫色，果实成熟后中间会出现凹陷，果皮也会变得粗糙。虽然这种病不会影响果实的口感，但外观上却不美观。初期发病时，叶子上会出现棕色斑点，表面也会皱缩，此时需要将叶子剪除，以防情况进一步恶化。同时还应喷洒波尔多液，以起到治疗效果。
三、尾孢斑点病
尾孢斑点病主要危害叶子、茎和果实，被感染的果实表面会形成枯斑，之后果皮会裂开，导致其他病菌侵入并导致果肉腐败。初期发病时，叶子上会出现直径为2-5毫米的褐色斑点，随后变为紫色，扩散到叶子两面，形状也不规则。发病后应及时喷洒铜制剂和嘧菌酯，以有效防治。
四、小穴壳果腐病
这种病在初期会在果皮上出现红色病斑，随后病菌会感染果实内部，果肉上会出现褐色条纹，果蒂周围还有紫褐色的病斑。果实成熟后，病斑会变黑凹陷，果实也会皱缩，表面会有菌丝体覆盖，内部腐烂并散发出难闻的气味。发现患病后，应立即剪除患病的枝梢，清除枯枝和病果，并适当施肥，增强其抗病能力。
